Chefirul are multe beneficii cunoscute pentru sănătate, mai ales pentru sistemul gastro-intestinal.

Efectul gastroprotector al chefirului. E un studiu făcut pe șoricei. Aici intervenția oamenilor de știință a fost în a induce ulceri acestor șoricei. De aceea ce nu poți să faci în măceri pe oameni, nu poți să faci în studiul pe oameni, să le induci ulceri și să vezi care dintre ei sunt protejați de chefir sau nu sunt protejați de chefir. Și ce-au făcut oamenii de știință a fost să ia un grup de șoricei și să îi împartă în trei grupe. Primul grup a fost grup de control. Grupul de control a consumat lapte. Al doilea grup a primit tratament inhibitor de pompă de proton. Este medicamentul care se reduce secreția de acid gastric și al treilea grup au primit kefir. 14 zile primul grup a băut lapte, al doilea grup a primit tratament antiacid și 14 zile al treilea grup a băut kefir. După aceste 14 zile li s-au administrat doze mari de anti-inflamator non-steroidian. Cum ar fi Buprofen, de exemplu, ketonal și așa mai departe. Anti-inflamator non-steroidian care se știe că în doze mari și pe timp îndelungat poate să ducă la gastrită și la ulcer pentru că inhibă secreția de mucus în stomac, deci practic protecția stomacului, grupul care a băut lapte. Fac ulcer, grupul care a primit inhibitor de pompă de proton, adică medicație antiacidă, așa cum se bănuia, se aștepta, nu face ulcer. Și surpriza majoră este că acel grup care nu a primit medicament, dar au băut chefir în fiecare zi, nu au făcut ulcer. Au fost protejați de ulcer doar prin consumul a 14 zile de chefir.