Cette vidéo montre comment préparer un petit jeu de données contenant six échantillons de jus d'orange dans Excel, l’enregistrer au format texte à séparateur de tabulation, puis l’importer dans R à l’aide du package R Commander (Rcmdr). L’instructeur décrit le paramétrage du séparateur de champ (tabulation) et du séparateur décimal (virgule), l’attribution d’un nom au jeu de données, la désignation de la première colonne comme noms des individus (row.names=1), et la conversion de la variable numérique « typeAmbiantFrais » en facteur avec des libellés « ambiant » et « frais ». Il montre également comment visualiser le jeu de données, obtenir un résumé descriptif et vérifier les types de variables. Le tutoriel couvre toutes les étapes nécessaires, depuis la préparation du fichier texte jusqu’à la mise en forme finale du jeu de données prête à l’analyse dans R.
Chapters
Nous allons voir comment importer des données dans R à l'aide d'un petit exemple. Dans cet exemple, nous avons 6 jus d'orange qui correspondent à 6 individus. Pour ces 6 jus d'orange, 2 variables qualitatives décrivent les jus d'orange: le type de jus d'orange, ambiant pour 1 et frais pour 2, et l'origine, de Floride ou autre que Floride. Nous avons également 3 variables quantitatives correspondant au glucose, au saccharose et au titre. Pour le nom des variables, il est préférable d'enlever tous les caractères spéciaux, c'est-à-dire l'apostrophe, les parenthèses et le slash. Nous pouvons maintenant enregistrer le fichier au format TXT en cliquant sur Fichier, Enregistrer sous, et dans le type de fichier, nous Nous allons choisir le texte séparateur tabulation *.txt et nous enregistrons. Excel nous précise que ce type de fichier .txt n'est pas le format classique et qu'on peut perdre certaines fonctionnalités. Nous cliquons cependant sur Oui. Nous pouvons maintenant ouvrir R. Nous allons importer les données dans R à l'aide du package R Commander. Pour cela, le package doit avoir été installé sur l'ordinateur. Si ce n'est pas le cas, reportez-vous à l'animation sur l'installation de package. Une fois le package installé sur l'ordinateur, nous allons charger le package en cliquant sur Package, Charger le package, et en choisissant dans la liste le package RCMDR. Le package est maintenant installé. Nous pouvons importer les données en cliquant sur Données, Importer des données, Depuis un fichier texte. Nous allons affecter un nom à notre jeu de données, par exemple orange. Nous allons lui préciser que le séparateur de champ ou le séparateur de colonne est la tabulation et que le séparateur de décimale est, dans notre cas, la virgule. Je valide ensuite par OK. Nous allons choisir le fichier orange.txt. Le jeu de données est maintenant importé. Nous pouvons visualiser ce jeu de données et faire quelques statistiques descriptives. Nous allons faire Statistiques, Résumé du jeu de données actif. 6 variables sont présentes: La première variable correspond en fait aux noms des individus. La deuxième variable, type ambiant frais, a été considérée comme une variable quantitative. Elle n'était composée que de 1 et de 2. La variable origine est qualitative. Elle prend 2 modalités: autre que Floride et Floride. 3 individus ont pris la modalité autre que Floride, 3 individus ont pris la modalité Floride. Les 3 autres variables, glucose, saccharose et titre sont des variables quantitatives. Nous allons préciser que la première variable correspond en fait aux noms des individus. Pour cela, nous allons reprendre la ligne de commande et taper à la fin virgule row.names= 1. On précise ainsi que le nom des individus est sur la première colonne. Nous sélectionnons l'ensemble de la ligne et nous cliquons sur soumettre. Nous pouvons maintenant changer la nature de la variable typeAmbiantFrais. Pour cela, nous allons sur Données, Gérer les variables dans le jeu de données actif et Convertir une variable numérique en facteur. Nous allons convertir la variable type ambiant frais et cliquer sur OK. Cette variable existe déjà et nous allons la remplacer. Nous allons coder la modalité 1 en ambiant et la 2e modalité en frais. Puis valider par OK. Le jeu de données est maintenant prêt, nous pouvons travailler sur ce jeu de données.